A-DNA

Z Multimediaexpo.cz

Struktura A-DNA

A-DNA je jedna z mnoha možných dvoušroubovicových struktur DNA. S nejhojnějším typem helikálního uspořádání - tzv. B-DNA - ji spojuje pravotočivé uspořádání, naopak se liší širším a poněkud více plochým tvarem. Vyznačuje se např. tím, že v jednom závitu je 11 bází, přičemž ty svírají s rovinou dvoušroubovice úhel 20 stupňů. Uvnitř dvoušroubovice vzniká poměrně výrazná axiální dutina.^[1] Voet uvádí, že není zcela jisté, zda se A-DNA vyskytuje za normálních okolností v živých buňkách.^[1] Minimálně dvouvláknová RNA a také hybridní DNA/RNA helix však zaujímají A-formu dvoušroubovice, které je velmi podobná A-DNA.^[2] Co se týče dvoušroubovice A-DNA, zřejmě v této konformaci existuje většina oligonukleotidů o délce menší než 10 párů bází, což jsou na buňku neobvykle malé a spíše vzácné molekuly.^[1] Lokální přeměny z B-DNA na A-DNA však pravděpodobně probíhají i v rámci dlouhých DNA molekul tvořících genomy organismů.^[3] A-DNA by mohla např. vznikat v TATA oblasti navázáním transkripčního faktoru TBP^[4] či u bakterií pomocí tzv. SASP proteinů.^[1] Kompletní přechod z B-DNA na A-DNA nicméně probíhá při poměrně extrémních podmínkách, jako je např. 75% relativní obsah vody.^[1]

Boční pohled na A-, B-, a Z-DNA

Související články

Reference

↑ ^1,0 ^1,1 ^1,2 ^1,3 ^1,4 VOET, Donald; VOET, Judith. Biochemie. 1.. vyd. Praha : Victoria Publishing, 1995. ISBN 80-85605-44-9.
↑ NOLAN, Jim. DNA Structure [online]. . Dostupné online.
↑ DUKE, Tom, et al. Multiple aspects of DNA and RNA: from Biophysics to Bioinformatics. Příprava vydání Didier Chatenay, et al. [s.l.] : Elsevier, 2005. ISBN 0-444-52081-3.
↑ VARGASON, J. M.; HENDERSON, K.; HO, P. S.. A crystallographic map of the transition from B-DNA to A-DNA. Proc Natl Acad Sci U S A., 2001, roč. 98, čís. 13, s. 7265-70. Dostupné online. ISSN 0027-8424.

Náklady na energie a provoz naší encyklopedie prudce vzrostly. Potřebujeme vaši podporu... Kolik ?? To je na Vás. Náš FIO účet — 2500575897 / 2010
Informace o článku. Článek je převzat z Wikipedie, otevřené encyklopedie, do které přispívají dobrovolníci z celého světa. Tento text je dostupný za podmínek Creative Commons 3.0 Unported – creativecommons.org. Originální článek na české Wikipedii

[voet-0] 1,0 ^1,1 ^1,2 ^1,3 ^1,4 VOET, Donald; VOET, Judith. Biochemie. 1.. vyd. Praha : Victoria Publishing, 1995. ISBN 80-85605-44-9.

[1] NOLAN, Jim. DNA Structure [online]. . Dostupné online.

[duke-2] DUKE, Tom, et al. Multiple aspects of DNA and RNA: from Biophysics to Bioinformatics. Příprava vydání Didier Chatenay, et al. [s.l.] : Elsevier, 2005. ISBN 0-444-52081-3.

[3] VARGASON, J. M.; HENDERSON, K.; HO, P. S.. A crystallographic map of the transition from B-DNA to A-DNA. Proc Natl Acad Sci U S A., 2001, roč. 98, čís. 13, s. 7265-70. Dostupné online. ISSN 0027-8424.

[1]

[2]

[3]

[4]